تدور أحداث مسلسل عطر الروح حول طبيبة نفسية اسمها "عطر" كرست حياتها المهنية والاجتماعية في معالجة العديد من حالات الاضطراب النفسي، وتعرض أحداث المسلسل مدى ذكاء هذه الطبيبة وقدرتها على معرفة خبايا روح الشخص الذي يحاورها أو يجالسها.

وتظهر الطبيبة وهي تعالج وتحاور شخصيات المسلسل وتمضي بهم قُدمًا إلى حياة أفضل، إلا أن نجاحها قد فتح أمامها أبوابًا لم تحسب عقباها، تتوالى الأحداث في المسلسل إلى أن يتم عرض عليها حالة مرضية لشاب يعاني من مشاكل نفسية خطيرة، يتم احتجازه في منزله.

ويتقدم إليها أحد الرجال المقربين من هذا الشاب طالبًا منها علاجه ومساعدته إلى استعادة وعيه، ليكون من الجانب الآخر من يهددها ويمنعها من معالجة الشاب لأسباب لم يتم الإفصاح عنها.

وتقف الطبيبة عطر بين نارين إما حياتها وحياة عائلتها وسلامتهم أو علاج الشاب ومساعدته للوقوف من جديد، فما قرارها وهل تستطيع فعلًا علاج هذه الحالة المرضية كغيرها من الحالات السابقة أم لا.